不过这些桀骜不驯的克隆人飞行员又岂是那么好驯服的？依靠克隆躯体加意识转移，他们早就已经是某种意义上的凡世神明了，一些克隆人军团选择了和新伊甸公国展开交锋。只可惜，他们的舰船大多都是阉割版的，不管是武器数量、武器威力、武器射程还是舰船引擎出力这些，都远不如各大帝国正版的舰船。
艾玛帝国的海军都没打赢新伊甸公国，他们的猴版舰船就更不可能轻松打赢了。
新伊甸公国和克隆人军团在埃索特亚星域的X-7B1X、C-PEWN这两个咽喉要道恒星系集结了超过三万八千五百七十二艘各型舰船。这两个恒星系一个可以直接北上抵达绝径、向东进入菲塔波利斯，一个同样可以向东进入菲塔波利斯。
一些大型的克隆人军团联盟甚至出动了自己的泰坦和超级航母参战，新伊甸公国自然也出动了自己的赤色黎明级泰坦和黑曜石级泰坦。这两款泰坦一款长度仅有18公里，但是另一款长度却达到了32公里。
当然了，新伊甸自然也出动了诸如拉格纳洛夫级泰坦和神使级泰坦。拉格纳洛夫级本质上其实就是新伊甸在神使级泰坦的图纸上进行大范围阉割和降低生产标准之后搞出来的速成品。说白了这神使级和拉格纳洛夫还和混沌的最出名的泰坦：行星杀手有着不清不楚的联系，因为这两款舰船本质上就是惠东让机油佬们搞出来的波动炮版的对标行星杀手的战舰。
神使级和拉格纳洛夫级都可以装备超级扩散式波动炮作为自己的末日武器。只不过这两处战场上，不管是克隆人联盟还是新伊甸公国都没有使用自己的末日武器。
克隆人的末日武器代价很大，而且使用过后泰坦在很长一段时间里都会进入贤者时间，成为一个只能被动挨打的铁憨憨。
新伊甸则是在等着克隆人首先使用自己的末日武器，这样的话新伊甸就可以用超大型扩散式波动炮给这帮自认为自己天命不凡的克隆人一点小小的震撼。
VPS装甲和幻象粒子装甲不能同时使用，因此启动了VPS装甲的舰船负责对抗克隆人的加达里、盖伦特、米玛塔尔、天蛇、天使、莫德团、古斯塔斯、姐妹会舰船。启动幻象粒子装甲的舰船负责对抗克隆人的艾玛帝国、血袭者、萨沙、新伊甸联合防御阵线、三神裔、殷郡、理性思维社团舰船。
克隆人那边也找到了应对方案：特混编队。实弹武器的舰队里掺入一些能量武器舰船，能量武器舰队里也掺入一些实弹武器舰船。
效果有，但不太明显，因为新伊甸公国的舰队在舰船下还有一层黑曜石装甲。舰体表面那层装甲都被打掉了也对舰船整体没有多大损失。对新伊甸来说自己损失的无非就是一些装甲、炮台、发射装置之类的缩不回去船体内部的装置而已，新伊甸后方的铸造工厂正愁没地方清理库存呢。