当他们接近黑暗旗舰时，黑暗旗舰释放出了一种强大的引力场，试图将他们拉向自己。同时，旗舰上的防御武器也集中火力朝着他们攻击。

“稳住！我们冲过去！” 林宇大喊道。

他们顶着强大的引力和攻击，继续朝着黑暗旗舰前进。在靠近旗舰的过程中，林宇发现旗舰的外壳上刻满了一些古老的符文，这些符文与他们在灵能庇护所中看到的符文有一些相似之处，但又有着本质的区别。这些符文似乎是黑暗力量的源泉，它们在不断地为黑暗旗舰提供能量。

“攻击那些符文，也许能削弱它的力量！” 林宇说道。

联盟成员们朝着黑暗旗舰外壳上的符文发动攻击，在攻击下，符文的光芒闪烁起来，黑暗旗舰的能量似乎出现了一些波动。黑暗旗舰察觉到了威胁，它开始调整防御，将更多的能量用于保护符文。

就在这时，联盟舰队的其他成员也突破了黑暗飞行器的包围，赶来支援林宇等人。他们集中所有的力量，继续对黑暗旗舰的符文和能量系统发动攻击。在激烈的战斗中，黑暗旗舰的防御逐渐出现破绽，符文在连续的攻击下开始出现裂痕。

然而，黑暗旗舰也发动了最后的反击。它启动了一个自毁程序，准备与联盟舰队同归于尽。自毁程序启动后，黑暗旗舰的能量开始急剧膨胀，整个星系团都被这股能量波动所笼罩。

“我们必须阻止它自毁，否则整个星系团都会被毁灭！” 林宇喊道。

联盟舰队拼尽全力，试图破坏黑暗旗舰的自毁程序。在最后一刻，他们成功地找到了自毁程序的关键节点，在一阵耀眼的光芒和能量爆炸中，黑暗旗舰的自毁程序被强行终止。黑暗旗舰在失去自毁能量的冲击下，受到了严重的损伤，符文彻底破碎，能量系统也陷入了瘫痪。

随着黑暗旗舰的被击败，黑暗漩涡开始逐渐缩小，周围的黑暗力量也在慢慢消散。联盟舰队成功地阻止了这场宇宙灾难，但他们也付出了惨重的代价。许多飞行器受损严重，大量队员受伤甚至牺牲。

在战后的清理和救援中，联盟舰队对这次事件进行了深入的分析。他们发现，这次的敌人与之前遇到的敌人都属于一个古老的黑暗势力，这个势力一直在暗中策划着统治宇宙的阴谋。而他们作为宇宙平衡的守护者，必须要彻底消灭这个黑暗势力，才能真正保护宇宙的和平与安宁。

在休整完毕后，联盟舰队带着新的使命，朝着黑暗势力可能隐藏的其他据点进发，他们知道，这场与黑暗的战争，才刚刚开始……