第一个是“自杀之谜”：多名科学家接连自杀。

这些科学家们的集体自杀引发了ZF的高度关注，为了解开真相，ZF委派了同样身为科学家的汪淼，用其专业知识来调查这些案件。

随后，便引出了第二个谜题，‘倒计时之谜。’

汪淼自从接手案件后，他的视网膜上便不断出现一组神秘的“幽灵倒计时”，只要他一睁开眼，倒计时就会出现。

随着调查的深入，汪淼逐渐发现这些谜题与一个名为“三体”的游戏有关。在这个游戏里，玩家会进入到一个所谓的三体世界。

三体世界的环境极为严酷，温度变化无常，热的时候可以将地面烤焦，冷的时候又会将石头冻成粉末。季节更替时而规律有序，时而彻底混乱。甚至整个行星都可能被太阳的引力吞噬，面临毁灭的威胁。

在这个游戏中，汪淼陆续遇到了周文王、墨子、秦始皇、牛顿等历史上的人物。他们都在用自己的方式去寻找三体世界的变幻莫测的规律，引导文明的进步并避免被恶劣的环境所摧毁。然而，他们的尝试无一例外地以失败告终。

最终，汪淼遇到了爱因斯坦。

爱因斯坦得出的结论是，这些人之所以会失败，是因为三体世界本质上不存在可预测的规律。

三体世界位于一个三星系统之中，由三颗质量不等的恒星组成，它们之间的引力相互作用导致了运动的完全无序。

亿万年前，这个星系中除了这三颗恒星，还存在无数行星，这些行星上曾孕育过众多生命和文明。但这些文明大多被三颗恒星无规律的运动所毁灭。

而这，也正是牛顿在1687年提出的三体概念。

于是爱因斯坦给三体文明指明的出路就是，飞向太空，寻找一颗合适的星球，然后移民。至此，庞大的三体舰队浩浩荡荡驶向太空，游戏到此通关。

游戏通关后，汪淼到了一个三体游戏玩家的线下聚会的邀请，在这次聚会上，他遇到了本书最重要的角色，叶文洁。

叶文洁出生于高知家庭，父亲是留学归国的知名物理学家。

在父亲影响下，她从小对科学充满了兴趣也很有天赋，可惜好景不长，在那个特殊的年代，她的父亲被PD致死，母亲背叛，自己也被人栽赃陷害，进入JY。从此。叶文洁对人类彻底失望。

后来，在父亲的学生杨卫宁的帮助下，她得以加入“红岸计划”，从而避免了牢狱之灾。

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在书中，“红岸计划”是通过发射电波打击敌人通信和侦查卫星，同时搜索可能存在的外星文明，尝试建立联系和交流。

监听频率范围为1000兆赫至兆赫，监听频道数，重点监测氢原子频率等，监听目标范围是半径1000光年约2000万颗恒星 。此外，还建立了以宇宙基本数学和物理原理为基础的自解译系统，用于与外星文明交流.

在参与‘红岸计划’期间，她发了太阳能量镜面增益反射效应的秘密，随后，她地利用太阳作为宇宙天线，向浩瀚的宇宙广播地球的存在的信息。

就这样，三体人发现了地球，并准备入侵她。

叶文洁的行动也引起了雷达峰上雷政委和此时已经成为她丈夫的杨卫宁的怀疑。

为了不暴露自己的计划，叶文洁利用检修悬崖设备的时机，亲手剪断了安全绳，雷政委和她丈夫杨卫宁当场摔死。

后来，那个时期结束，“红岸计划”被取消，叶文洁平反，回到当年她父亲所在的大学任教。

在一次偶然的机会，她结识了伊文斯，并与他建立了“地球三体组织”，准备迎接三体舰队占领地球，同时在三体舰队没来之前，帮忙搞破坏。

而《三体》游戏，就是他们用来筛选同伴的工具。

后来，在全球的努力下，人类利用“古筝计划”彻底的摧毁了伊文斯和他的“地球三体组织”。

……

智子是什么？

它是由三体人创造的先进人工智能，其蓝本是质子。

三体人将质子从十一维的结构展开至二维平面，在其上精细地刻蚀电路，将其改造成一台微型计算机，然后再将其恢复到高维状态，从而形成一个可操控的微观粒子。

这种名为智子的微观粒子能够从真空中汲取能量，并以接近光速的速度穿梭于宇宙之间。

它们还能够利用量子纠缠的特性，实现跨越任意距离的即时通讯。

在三体人看来，基础科学，尤其是基础物理学，是科技进步的根基。因此，只要能够封锁地球上的基础科学研究，地球文明的发展就会彻底陷入停滞。基于这一战略，三体人向地球发射了两颗智子。

一颗智子负责监视人类的一举一动，而另一颗则通过干扰粒子对撞实验，旨在封锁地球的基础科学。

当科学家们全神贯注于粒子对撞实验时，智子的干扰导致实验结果出现错误。即便是相同的实验，不同的人进行也会得到截然不同的结果；同一个人在不同的时间、不同的地点重复实验，结果也会大相径庭。

研究工作陷入了僵局，科学家们的信念受到了前所未有的冲击，对研究的未来感到极度绝望，导致了一系列自杀事件的发生。

当各国代表聚在一起商讨如何应对这场人类文明面临有史以来最大的威胁时，会议的中央出现了用6种官方语言写的一句话。

“你们是虫子！”

这是三体文明通过智子，首次正式且公开地向人类发出的挑战。

从此，人类文明被一片巨大的阴影所笼罩。